水稻配方施肥，是现阶段比较科学的一种施肥方法，要注意以下三方面。
一要注意将配方肥中的氮（氮素）、磷（五氧化二磷）、钾（氧化钾）的指标值，换算成化肥实用量。例如：1亩田通过测土得知应该施氮素8公斤、五氧化二磷3公斤、氧化钾5公斤。怎样将这些数据换算成尿素、过磷酸钙、氯化钾？首先，要查出各种肥料的有效成分。如尿素含氮为46%，可按以下公式计算：尿素（公斤）=8÷46%=17.39公斤。磷钾肥料的实用量也是如此计算。
二要注意从总施氮素量中减去有机肥料中可利用的氮素含量，所欠部分用氮化肥补充。根据有关资料得知，红花草子中的0.5公斤氮素只相当于0.435公斤化肥中的氮素；猪粪中的0.5公斤氮素只相当于0.355公斤化肥氮素；牛粪中的0.5公斤氮素只相当于0.305公斤化肥氮素。假如某一块田每亩可翻沤红花草子1000公斤，还需补施多少氮素呢？我们知道，鲜草子一般含氮素0.33%，1000公斤草子含量就是3.3公斤，换算成化肥氮素就是2.87公斤，说明这块田需补施氮素7.31公斤。如果是补施含氮16%的碳铵，则需44公斤（7.13÷16%）。磷、钾可按实际需要施用，不必除去有机肥料中的磷、钾素。
三要有针对性地配合施用微肥。一般石灰性稻田、房屋周围的田块、连年大量施用磷肥的田，有机肥料施用太多的田、冷浸烂泥田和新开垦的黄泥田都缺锌、缺硼。每亩用硫酸锌1.5-2公斤、硼砂250克左右，拌干细肥土撒施做基肥，每2-3年施一次。
