绿色供应链的体系构建残缺不齐。绿色供应链管理所追求的是经济利益和绿色利益即环境利益双丰收，以致达到社会的可持续发展。这里的绿色效益包括环境保护和资源优化利用。而要达到这样的目标首先要考虑的是各种影响因素。这是我们把影响因素分为两大类——驱动因素和障碍因素。
1）驱动因素包括四个方面：
增强企业的竞争力提高整个供应链的效益。企业在激烈的市场竞争中寻找联盟来实施绿色供应链。在绿色供应链中可与上下游企业进行整合，优势互补，强强联合，为整个供应链带来更多效益。
增加客户价值。绿色产品不仅保护环境，也为客户带来绿色收益，可赢得顾客的长远信任。
提升企业绿色形象。实施绿色供应链的企业可以树立产品的安全可靠、重视社会责任的信息，赢得顾客青睐。
可规避绿色技术贸易壁垒。世界上很多国家尤其是发达国家都重视生态问题，并为此设立了相应的技术条款和环保法规。而企业要长久生存就必须使产品达到相应的绿色标准，而要达标就必须实施绿色供应链。
2）障碍因素包括五个方面：
实施绿色供应链会带来财务负效应。绿色供应链虽能提高资源的利用效率，在一定程度上降低成本，但绿色回收和废弃物的处理却需要花费巨大的代价，两者相抵可能会使财政入不敷出。
企业之间缺乏信任。企业在决策时总是从自身利益最大化出发，而非整个供应链或社会效益最大化原则。企业希望自己的上下游企业实施更多的绿色工艺，这样就可为自己的产品达到绿色标准而花费最小的成本。
实施绿色供应链的技术和知识欠缺。虽然绿色供应链在理论上可以建立，但相应的绿色产品的开发和废物的处理技术和手段有待建立和提高。
环境标准与税费制度仍不完备。各个国家环境标准不同，尤其是中国环境制度不健全，执法监督不利。
企业文化（企业的核心价值观）不同。企业文化是影响供应链企业间合作关系的首要因素。正所谓“道不同不相与谋”。如果双方没有互相理解的文化理念，则很难合作，即使合作，也会因管理成本过高而失败。
3）绿色供应链的运作分析
前面分析了绿色供应链构建时应考虑的相关因素，下面探讨绿色供应链是如何运作的。
这里以绿色供应链管理信息系统（GSC-MIS）为核心，它通过Internet与各地的供应链、制造商、分销商、零售商和物流商相连接，互换信息。而供应商、制造商等又各自组建自己内部的管理信息系统（即内部MIS）。零售商组建内部MIS与用户相联系。其它供应商、制造商、分销商、物流商等与零售商同样道理。GSC-MIS又通过Intranet与环境管理系统（EMS）、知识管理系统（KMS）、人力资源管理系统（HRMS）、财务管理系统（FMS）、质量管理系统（QMS）连接在一起。而决策支持系统（DSS）通过EMS、KMS、HRMS、FMS、QMS反馈的信息，同时考虑社会系统的一些因素，并听取专家的建议后决定是否流程重组或改进，把最终的结果传递给GSC-MIS。整个绿色供应链就这样运行管理。
